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億迅生物-實(shí)時(shí)熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)科普,快來圍觀
技術(shù)簡(jiǎn)介:
實(shí)時(shí)熒光定量PCR (Quantitative Real-time PCR)是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中,以熒光化學(xué)物質(zhì)測(cè)每次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。通過內(nèi)參或者外參法對(duì)待測(cè)樣品中的特定DNA序列進(jìn)行定量分析的方法。·
Real-timePCR是在PCR擴(kuò)增過程中,通過熒光信號(hào),對(duì)PCR進(jìn)程進(jìn)行實(shí)時(shí)檢測(cè)。由于在PCR擴(kuò)增的指數(shù)時(shí)期,模板的Ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線性關(guān)系,所以成為定量的依據(jù)。
技術(shù)應(yīng)用:
1 核酸定量分析:對(duì)傳染性疾病進(jìn)行定量定性分析,病原微生物或病毒含量的檢測(cè) , 比如近期流行的甲型H1N1流感, 轉(zhuǎn)基因動(dòng)植物基因拷貝數(shù)的檢測(cè),RNAi 基因失活率的檢測(cè)等。
2 基因表達(dá)差異分析: 比較經(jīng)過不同處理樣本之間特定基因的表達(dá)差異 ( 如藥物處理、物理處理、化學(xué)處理等 ) ,特定基因在不同時(shí)相的表達(dá)差異以及cDNA芯片或差顯結(jié)果的確證。
3 SNP 檢測(cè):檢測(cè)單核苷酸多態(tài)性對(duì)于研究個(gè)體對(duì)不同疾病的易感性或者個(gè)體對(duì)特定藥物的不同反應(yīng)有著重要的意義,因分子信標(biāo)結(jié)構(gòu)的巧妙性,一旦SNP 的序列信息是已知的,采用這種技術(shù)進(jìn)行高通量的 SNP 檢測(cè)將會(huì)變得簡(jiǎn)單而準(zhǔn)確。
4 甲基化檢測(cè):甲基化同人類的許多疾病有關(guān),特別是癌癥, Laird 報(bào)道了一種稱作 Methylight的技術(shù),在擴(kuò)增之前先處理 DNA ,使得未甲基化的胞嘧啶變成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不受影響,用特異性的引物和 Taqman探針來區(qū)分甲基化和非甲基化的 DNA ,這種方法不僅方便而且靈敏度更高。
正確分析結(jié)果:
1、如果有標(biāo)準(zhǔn)曲線,按照標(biāo)bai準(zhǔn)曲線計(jì)算;
2、一般都是相對(duì)量,則zhi用delta delta CT方法來計(jì)算;
3、引物或探dao針降解:可通過PAGE電泳檢測(cè)其完整性;
4、模板量不足:對(duì)未知濃度的樣品應(yīng)從系列稀釋樣本的高濃度做起;
5、看CT值是分析熒光定量PCR較直觀的一個(gè)數(shù)據(jù),CT值一般在35左右就失去參考價(jià)值了,平時(shí)我們實(shí)驗(yàn)室用BIODAI-PCR熒光定量法測(cè)得的擴(kuò)增曲線的起跳值基本在30左右。
將標(biāo)記有熒光素的Taqman探針與模板DNA混合后,完成高溫變性,低溫復(fù)性,適溫延伸的熱循環(huán),并遵守聚合酶鏈反應(yīng)規(guī)律,與模板DNA互補(bǔ)配對(duì)的Taqman探針被切斷,熒光素游離于反應(yīng)體系中,在特定光激發(fā)下發(fā)出熒光,隨著循環(huán)次數(shù)的增加,被擴(kuò)增的目的基因片段呈指數(shù)規(guī)律增長(zhǎng),通過實(shí)時(shí)檢測(cè)與之對(duì)應(yīng)的隨擴(kuò)增而變化熒光信號(hào)強(qiáng)度,求得Ct值,同時(shí)利用數(shù)個(gè)已知模板濃度的標(biāo)準(zhǔn)品作對(duì)照,即可得出待測(cè)標(biāo)本目的基因的拷貝數(shù)。
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